Untuk bangunan masjidnya berbentuk joglo dengan atap tumpang atau susun 3 sama seperti halnya masjid – masjid kuno yang ada di Jawa.
Sedangkan Bangunan Masjid dan Makamnya berada di dalam satu komplek yang mana ini merupakan salah satu ciri khas dari tata letak masjid dan makam yang ada di pulau Jawa pada masanya.
Bentuk jirat yang ada di makam adalah bentuk jirat kuno yang memiliki beberapa variasi lain diantaranya bentuk gada, matahari, kurawal. Makam Sunan Kalijaga sebagai maka utama sehingga lokasinya ada di halaman belakang.
Baca Juga: Ini 4 Ayat Al Quran Keutamaan Sedekah: Tenangkan Hati, Bahagiakan Hidup
Untuk bisa masuk ke komplek makam sunan kalijaga maka anda setidaknya harus melewati tiga pintu gerbang.
Bagi peziarah makam Sunan Kalijaga ini, setiap pengunjung tidak ditarik biaya. Hanya saja mereka bisa menyumbang seiklasnya di kotak-kotak yang ada di sepanjang jalur menuju makam. Maupun kotak yang ada di ruang juru kunci.***